在伊斯坦布尔文化版图上寻找一座致力于现代和当代艺术的永久家园这一宏愿，源于埃杰扎巴希家族的远见卓识以及1987年国际展览所引发的巨大公众兴趣。在内贾特·F·埃杰扎巴希博士和奥娅·埃杰扎巴希的领导下，在伊斯坦布尔文化艺术基金会的支持下，这个梦想最初通过将金角湾前纺织厂费舍内改建为博物馆空间的早期努力而初具雏形。
博物馆命运真正的转折点随着加拉塔码头土耳其海事局使用的4号仓库（一个干货仓库）的发现而到来。这座工业建筑曾于2003年举办过第八届伊斯坦布尔国际双年展，在获得政府划拨并在欧盟入盟谈判日期之前完成的要求下迅速改造。埃杰扎巴希集团与多古什集团及比尔吉利控股公司的投资，融合了塔班勒奥卢建筑事务所的极简主义点缀。
4号仓库从单纯的仓库蜕变为艺术殿堂，于2004年12月11日作为土耳其第一家现代和当代艺术博物馆开门迎客。在开业的第一周就迎来了众多艺术爱好者，这个工业“loft”时代将城市的当代艺术场景锚定了14年，并在国际上被公认为土耳其的现代面孔。
作为加拉塔港城市更新项目的一部分，原建筑被拆除后，博物馆于2018年至2022年期间临时搬迁至贝伊奥卢由亚历山大·瓦洛里于1896年设计的前法国联盟大楼。在历史文脉中度过的这四年过渡期，使博物馆与城市多元层面的联系保持活力，同时也加剧了人们对其永久回归的期待。
在原址重生的现博物馆建筑由世界著名普利兹克奖得主建筑师伦佐·皮亚诺及其事务所伦佐·皮亚诺建筑工作室设计。这座五层建筑于2023年5月4日开放，是皮亚诺在土耳其的第一个项目，实现了他“直接在水面上打造一艘飞行船”的愿景。
建筑的立面采用了受博斯普鲁斯海峡光影反射启发的灰色铝板，全天候营造出不断变化的阴影交错。底层由让人联想起森林中树干的圆柱支撑，通过提供一个将城市元素和街道汇聚在一起的通透全景来迎接访客。
收藏和展览项目涵盖了1950年以来的土耳其艺术以及国际作品。在埃杰扎巴希家族的捐赠以及伊斯坦布尔绘画和雕塑博物馆、土耳其银行等机构的长期借展丰富下，博物馆将绘画、雕塑、摄影、新媒体和建筑融为一体。
俯瞰大海并配有浅水倒影池的屋顶露台，为访客提供历史半岛和加拉塔塔的全景。这个公共空间被设计成一个宁静的观景台，水与天在这里与城市的轮廓交融在一起。
多年来，伊斯坦布尔现代艺术博物馆在其室内外空间举办了无数展览、接待了众多艺术家并斩获多项荣誉，它将卡拉柯伊水滨的工业记忆与当今的创意活力融为一体，作为一座传奇机构继续塑造着城市的文化身份。
